Учебный процесс и научные исследования осуществляют следующие кафедры:

• Анатомии и физиологии животных;
• Внутренних незаразных болезней, хирургии и акушерства;
• Неорганической и биологической химии;
• Разведения сельскохозяйственных животных и генетики;
• Частной зоотехнии;
• Эпизоотологии, микробиологии и вирусологии;
• Физического воспитания и спорта.

На факультете ведётся подготовка студентов по двум специальностям:

«Зоотехния» с присвоением квалификации – зооинженер.

Специализации:
«Генетика и селекция животных»;
«Технология первичной переработки молока»;
«Птицеводство».

«Ветеринария» с присвоением квалификации – ветеринарный врач.

Специализации:
«Ветеринарно-санитарная экспертиза»;
«Болезни мелких домашних и экзотических животных».

С 2005 года на факультете ведется подготовка студентов, имеющих среднее специальное образование по специальности «Ветеринария» с сокращенным сроком обучения (4,5 года).
На факультете работают 64 преподавателя, в том числе 12 докторов наук, 37 кандидатов наук, более 50% – выпускники факультета.

Сейчас на факультете успешно трудятся умудренные знаниями, истинные учителя и наставники, самоотверженные созидатели: Герой труда, заслуженный работник высшей школы, профессор К.В. Петрова; заслуженные деятели науки, профессора Э.Ф. Ложкин, И.П. Примакин; заслуженные работники высшей школы, профессора В.В. Бурдейный, Ф.Ф. Лягин, Л.Г . Смирнов, Б.В. Шалугин; профессора В.Н. Бочкарев, Н.С. Баранова, Н.М. Кебец, В.Ф. Позднякова, Л.П. Соловьева; заслуженный ветеринарный врач, профессор Р .В. Бурдейная.

Процесс обучения тесно связан с практической деятельностью. В клинико-диагностическом центре факультета ведется амбулаторный прием животных, в том числе редких и экзотических видов, имеются стационары, где каждый студент может попробовать себя в качестве практикующего врача, а на старших курсах курирование больных животных входит в программу обучения. В клинике функционирует кабинет физиотерапии, рентгено- и УЗИ– диагностики, операционные.

На факультете созданы уникальные научно-учебные музеи: зоологический, анатомический, патологоанатомический, эмбриологический, кранеологический, палеонтологический, паразитологический, микробиологический, ветеринарных препаратов, ветеринарно-санитарной экспертизы. 

Ежегодно по различным международным образовательным программам преподаватели и студенты проходят стажировку и обучение за рубежом (Австрия, Англия, Германия, США, Франция).
Юноши имеют возможность продолжить обучение в единственном в мире Военно-ветеринарном институте (г . Москва).
За время функционирования факультетом подготовлено более 4000 ученых зоотехников и зооинжинеров, 500 ветеринарных врачей для сельского хозяйства Костромской, Ярославской, Московской, Ленинградской областей и других регионов России.

Наши выпускники работают руководителями предприятий агропромышленного комплекса, государственными служащими в Министерстве сельского хозяйства РФ, администрациях областей, городов и районов, в департаментах агропромышленного комплекса, возглавляют районные управления сельского хозяйства и ветеринарии, ветеринарными врачами и зоотехниками в с.-х. предприятиях.

В их числе:
Бычков А.И. и Комиссаров Б.В.– депутаты Костромской областной думы;
Дупак В.Я. – председатель комитета Московской областной думы, доктор наук;
Потемкин В.И. – начальник отдела животноводства Департамента АПК Костромской области; 
Баранов А.В. – директор Костромского НИИСХ, доктор наук;
Иванова Л.А. – директор АО «Гридино»;
Гюльбеков Б.В. – директор АОЗТ «Птицефабрика «Костромская»;
Гюльбеков В.В. – директор ОАО «Птицефабрика «Волжская»;
Шатров Е.А. – директор АОЗТ «Шарьинская птицефабрика»;

Доктора наук, профессора, заслуженные работники РФ: Лягин Ф.Ф.,Соловьева Л.П., Баранова Н.С., Шарова Л.Г ., Шалугин Б.В., Позднякова В.Ф

Известные выпускники факультета:
Петренкова С.В. – зам. начальника Россельхознадзора по Костромской области;
Орлов Е.В. – начальник СББЖ Ростовского района Ярославской области;
Шашкин Д.В. – главный ветеринарный врач Некоузского района Ярославской области;
Пучков В.В. – заместитель директора Областной ветеринарной лаборатории;
Суханова (Вакурова) Е.Н. – директор Антроповской межрайонной ветеринарной лаборатории;
Чистяков С.А. – зам. начальника Кологривской районной станции по борьбе с болезнями животных;
Комиссаров В.Б. – первый заместитель генерального директора ЗАО «Галичское» по птицеводству , кандидат ветеринарных наук;
Осадченко А.А. – главный ветеринарный врач ЗАО «Галичское» по птицеводству ,кандидат ветеринарных наук; 
Борисова О.Н. – главный ветеринарный врач ЗАО «Мантуровская птицефабрика»;
Костров А.П.– главный ветеринарный врач ЗАО «Шарьинская птицефабрика»;
Мозжухин М.С. – начальник противоэпизоотического отряда ОГУ «Костромская районная станция по борьбе с болезнями животных».